单病种付费指的是对部分疾病医疗费用实行按病种付费。单病种付费是医疗保险费用支付方式之一，采取按规定病种费用支付额后付制的结算方式，它分为医疗保险基金支付额、参保人员自付额两部分，参保人员在出院时需按规定交纳自付额及不列入病种费用自付额的医疗服务费用；应由医疗保险基金支付的，定点医院记账后向医保经办机构申报结算。无论实际费用高于或低于规定支付额，均按规定的支付额支付。