庆长三年（1598年），丰臣秀吉卒。之后在庆长十年（1605年），德川家康开创江户幕府后两年，做为北海道唯一的大名，拥有一万石，但实质控制领地达二十万石。

此外松前庆广也利用诸弟成立分家、诸子和各有力大名缔结关系，编织出一张血缘网稳固本家，次男忠广在庆长九年时请仕将军家，担任将军德川秀忠的旗本，得“忠”字并居住于江户，在庆长十五年（1610年）续任从五位下隼人正的官位，拜领下野结城一千石，元和元年又加封武藏八幡一千石、都合两千石。五男继广入仕加贺前田家，担当和前田利长交谊之职。六男景广继承母系河野氏，负责掌理箱馆，七男安广出仕仙台伊达家，并于宽永六年在伊达政宗搓合下迎娶片仓重长之女，被列为准一门家臣。

庆长十一年（1606年），松前庆广有鉴山城型态的居馆德山馆有诸多不便，于是在德山南方邻近海港的福山台地另筑福山馆迁移过去做为新居馆。

庆长十九年（1614年），庆广率军参予大阪冬之役，阵中担任一门众笔头的四男由广因为有与大阪方内通的嫌疑，庆广壮士断腕地毅然下令由广自刃。翌年的大阪夏之役中，庆广带次男忠广参阵，役中忠广奋勇作战立下功勋终让幕府方解除对松前家与丰臣家私通谋叛的怀疑。

元和二年（1616年）十月十二日，松前庆广剃发号海翁，长子盛广之子长孙松前公广以二十岁之龄继位家督，同年去世，享年六十六岁，公广承继庆广的政策在当年于礼髭、大泽两地成功开采砂金，之后构筑福山城建立新的城下町，积极促进商人流通以振兴经济，并建立商场知行制加以维护，确立了松前藩初期的财政基础。

天正十五年，安东爱季在与户泽盛安交锋的唐松野之战中败退旋後即因病身故，由次男实季即位。天正十七年，凑系的安东高季在南部和户泽的煽动下叛变，这场被称作凑系骚乱的家中最终在实季攻克凑城後确定胜利，期间封地在虾夷的庆广以他出色的外交手腕既两面讨好又维持中立，在实季占优势後高举桧山安东家为正统传承之名投入实季方，所以乱後实季的家臣整顿及政体改革都未损到他的实力。

天正十八年，继承信长霸业的丰臣秀吉出兵关东攻打小田原北条家，同时催促奥羽诸大名共同出兵参与讨伐，意欲趁势一统天下，主家安东实季考虑再三後决定投降发兵参战，获得秀吉的安堵状。战後秀吉统一全国并进行奥羽检地，庆广趁机与担任津轻地方检地奉行的前田利家、利长父子交好，且透过当时人在仙北的大谷吉继向秀吉进贡虾夷的毛皮和织物，之後在同年中任从五位下民部少辅并参见秀吉，庆广很清楚秀吉是能帮助他独立的关键，只要掌握天下权柄的他说一句话，实季就没有办法拒绝，而且秀吉本身是绝不愿意看到有任一个地方大名拥有太强的势力，互相牵制是他转易封地的大原则，只要取得秀吉的信任，就跟立花宗茂由大友家分出、伊集院忠仓由岛津家分出一样，秀吉绝对乐意看到蛎崎家自立门户的局面，因而庆广趁此时机相当积极地与丰臣秀吉接近交往。

天正十九年，九户政实起事，在受到威胁的南部家当主南部信直请求下派羽柴秀次为总大将，蒲生氏乡、大谷吉继为副将出兵讨伐，并动员羽州诸将助阵，此役之中蛎崎庆广亦率军参战和津轻为信南下，与小野寺义道、户泽盛安及秋田实季合流将九户城包围，九户政实战败投降，战阵之中蛎崎庆广麾下虾夷军使用附子矢大大活跃，因而足以在军事会议中与实季平起平坐，可见他秋田家代官立场的改变。

文禄二年，秀吉出兵朝鲜，庆广由虾夷远至肥前名护屋参阵，秀吉大喜并多加赞赏，当场确认蛎崎氏对虾夷的支配，同时上奏天皇封庆广从五位下志摩守的官位，并赐下「虾夷岛主」的朱印状和桐章。当时庆广四十四岁，从他继任家督後历经十一年的光阴，终于脱离秋田家被官身份成为独立大名，控制领地达二十万石。

庆长三年，丰臣秀吉卒，蛎崎庆广迅速在於大阪城西丸谒见德川家康江户幕府後两年，做为北海道唯一的大名，拥有一万石格。同时松前庆广与幕府交涉成功，得到幕府下赐的「黑印状」，与北海道原住民爱奴人交易的权力，将许多高价的渔产和农产拢断，以此建立整体的贸易制度当时连近江商人都来虾夷进行商业交易。庆长十四年，庆广改任伊豆守。

庆长十一年，松前庆广有鉴山城型态的居馆德山馆有诸多不便，於是在德山南方邻近海港的福山台地另筑福山馆迁移过去做为新居馆。